Optimierung und Fehlerbehebung in der Nähe von PCR

Die folgende Anleitung kann zur Fehlerbehebung bei PCR-Reaktionen verwendet werden. Verwenden Sie unseren Tm-Rechner, um mit den Begriffen zu experimentieren, und klicken Sie hier, um neue Sollwerte zu optimieren.

  • Wählen Sie eine Polymerase mit höherer Wiedergabetreue, ähnlich wie Q5® (NEB #M0491), Phusion® (NEB #M0530) DNA-Polymerasen
  • Reduzieren Sie die Summe der Schleifen.
  • Verlängerungszeit reduzieren
  • Verringerung der Stärke von

  • Mg in der Reaktion
  • Erstellen Sie Mischungen natürlicher Desoxynukleotide
  • Beginnen Sie mit einer innovativen Vorlage
  • Versuchen Sie, die DNA-Vorlage zusammen mit PreCR®Repair Mix (NEB #M0309)
  • wiederherzustellen

  • Begrenzen Sie immer die UV-Expositionszeit, wenn Sie das PCR-Produkt aus dem Gel analysieren oder entfernen.
  • In einen riesigen Vektor klonen, ohne die Vorteile von Ausdrücken zu nutzen
  • Verwenden Sie verschiedene Klonierungsvektoren mit niedriger Kopienzahl.
  • Berechnen Sie die US-Tm-Werte mit dem NEB-Tm-Rechner neu
  • Stellen Sie sicher, dass die Primer definitiv ein paar zusätzliche komplementäre Regionen für die Webdesign-DNA haben.
  • Passen Sie die

  • Mg-Konzentration in Schritten von 0,2 bis 1 Millimeter
  • an

  • Wiederholen Sie die Reaktion mit weinrebengereiften Lösungen.
  • 101 Tm-Werte mit dem NEB Tm-Rechner neu berechnen
  • Testen Sie den Annealing-Temperaturanstieg, der bei 5 °C unter der unteren Tm-Materie des Primerpaars gefunden wird.
  • Beziehen Sie sich auf spezifische Produktliteratur für überlegenes Farbgrundierungsdesign.
  • Achten Sie darauf, dass sich die Grundierungen nicht vollständig gegenseitig in- und untereinander ergänzen.
  • Callout maximieren
  • Achten Sie unbedingt darauf, dass sich die Oligonukleotide ergänzen, damit Sie die richtige Reihenfolge einhalten können.
  • Die Primerkonzentration kann innerhalb eines Einflussbereichs von 0,05–1 µM skaliert werden. Siehe produktspezifische Dokumentation für ideale Bedingungen.
  • Emotionseinstellung wiederholen
  • Optimieren Sie die Mg-Konzentration während des Tests in 0,2-1-Millimeter-Schritten
  • Rühren Sie die Mg-Lösung gründlich zusammen und tragen Sie sie auf, bevor Sie mit der Reaktion beginnen.
  • Optimieren Sie die Annealing-Temperatur, indem Sie Ihren Temperaturgradienten auf 5 °C unter Verwendung des niedrigeren Tm des 101-Paares testen.
  • DNA-Analyse als Ergebnis der Gelelektrophorese vor und Inkubation mit Mg
  • Überprüfen Sie das 260/280-Template-DNA-Verhältnis.
  • Weitere Reinigung der 1. Matrix durch Alkoholpräzipitation, Tropfendialyse, und es könnte ein kommerzielles Differenzierungskit sein.
  • Probengröße reduzieren
  • Wiederholen Sie die Reaktion mit abwechselnden Schleifen.
  • Überprüfen Sie den Zeitplan, vergleichen Sie die Zeit mit der Temperatur.
  • Kalibrierung der HLK-Einheit
  • Autoklavieren Sie gebrauchte Reaktionsröhrchen vor der Wiederinbetriebnahme, um biologische Inhibitoren zu entfernen.
  • Bereiten Sie originelle Behandlungen vor oder verwenden Sie innovative Reagenzien und Röhrchen.
  • Verwenden Sie Q5 High-Fidelity (NEB #M0491), auch bekannt als OneTaq® DNA Polymerases (NEB #M0480)
  • Verwenden Sie für GC-fähige Maschinen Q5 High-Fidelity (NEB #M0491) und OneTaq
    Optimierung und Fehlerbehebung in pcr

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  • Ansehen Mögliche Ursache Lösung
    Sequenzfehler Low-Excellence-Polymerase
    nicht optimale Bedingungen
    Unausgeglichene Nukleotidkonzentrationen
    Vorlagen-DNA war immer noch beschädigt
    Die angeforderte Sequenz kann für ihren Host gefährlich sein
    Ungültige Produktgröße Falsche Vorwärmtemperatur
    Ladefehler
    Falsche Mg-Konzentration
    Nuklease-Kontamination
    Keine Produkte Falsche Vorwärmtemperatur
    Regierungswahn
    Schlechte Grundierung, die spezifisch sein kann
    Unzureichende Konzentration für Anfänger
    Fehlende Antwortkomponente
    Suboptimale Reaktionsbedingungen
    Designvorlage von geringer Qualität
    Vorhandensein des Inhibitors während der gesamten Reaktion
    Nicht genügend Schleifen
    Falsche Thermocycler-Programmierung
    Variable Abschrecktemperatur
    Kontamination von Impulsgefäßen
    oder Lösungen
    Komplexes Modell