ottimizzazione e risoluzione dei problemi su pcr

È possibile utilizzare la seguente guida che può risolvere i problemi delle reazioni PCR. Usa il nostro calcolatore Tm per sperimentare gli approcci e fai clic qui per ottimizzare questi setpoint.

  • Scegli una varietà di polimerasi ad alta fedeltà come Q5® (NEB #M0491), Phusion® (NEB #M0530) DNA polimerasi
  • Riduci la moltitudine di loop.
  • Riduci i tempi di estensione
  • Ridurre l’interesse di

  • Mg nella reazione
  • Crea miscele di deossinucleotidi naturali
  • Inizia con un nuovo modello nuovo
  • Prova a ricostruire il modello di DNA che contiene PreCR®Repair Mix (NEB #M0309)
  • Limitare sempre il tempo di esposizione ai raggi UV durante l’analisi o frequentemente il prodotto PCR senza gel.
  • Clone su un enorme vettore privo di espressioni
  • Utilizza diversi vettori di clonazione a basso numero di copie.
  • Ricalcola i valori Tm a livello nazionale utilizzando il calcolatore NEB Tm
  • Assicurati che i primer ricevano alcune regioni extra complementari quando si tratta del DNA del web design.
  • Regola la concentrazione di

  • Mg in incrementi di 0,2-1 millimetri
  • Ripetere la reazione con soluzioni accuratamente pulite.
  • Ricalcola 101 valori Tm utilizzando il calcolatore NEB Tm
  • Testare la pendenza della temperatura di ricottura iniziando verso 5°C al di sotto dell’obiettivo Tm inferiore della coppia di primer.
  • Fare riferimento alla documentazione specifica del prodotto per un design 101 superiore.
  • Assicurati che i primer non si completino sempre a vicenda i particolari all’interno e tra loro.
  • Espandi callout
  • Rendere particolari gli oligonucleotidi si completano a vicenda mantenendo l’ordine corretto.
  • La concentrazione di primer può essere scalata all’interno di questo intervallo influente di 0,05-1 µM. Consulta la documentazione specifica del prodotto per le condizioni ideali.
  • Ripeti la configurazione delle emozioni
  • Ottimizza la concentrazione di Mg durante il test in incrementi di 0,2-1 millimetri
  • Agitare accuratamente la soluzione di Mg e applicarla prima di iniziare la reazione.
  • Ottimizza la temperatura di ricottura testando un nuovo gradiente di temperatura o ricottura di 5 °C, ecco alcuni dei Tm più bassi della coppia 101.
  • Analisi del DNA mediante processo di elettroforesi su gel prima e ricerca dell’incubazione con Mg
  • Controlla il rapporto del DNA del modello 260/280.
  • Ulteriore purificazione della prima matrice mediante precipitazione alcolica, dialisi a gocce o forse un kit di differenziazione commerciale.
  • Riduci la dimensione del campione
  • Ripeti la reazione con numerosi cicli.
  • Controlla il programma, studia il tempo rispetto alla temperatura.
  • Calibrazione unità HVAC
  • L’autoclave utilizzava provette di reazione prima di operare realmente per rimuovere gli inibitori biologici.
  • Prepara trattamenti nuovi di zecca o utilizza reagenti e provette innovativi.
  • Utilizzare Q5 High-Fidelity (NEB #M0491), noto anche come OneTaq® DNA polimerasi (NEB #M0480)
  • Per le auto compatibili con GC, usa Q5 High-Fidelity (NEB #M0491) altrimenti OneTaq
    ottimizzazione e risoluzione dei problemi in pcr

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  • Guarda Possibile causa Soluzione
    Errore di sequenza Polimerasi a bassa affidabilità
    condizioni non ottimali
    Concentrazioni di nucleotidi sbilanciate
    Il DNA del modello era ancora danneggiato
    La sequenza essenziale potrebbe essere pericolosa per tutto l’ospite
    Taglia prodotto non valida Temperatura di preriscaldamento errata
    Errore di caricamento
    Concentrazione di Mg errata
    Contaminazione da nucleasi
    Nessun prodotto Temperatura di preriscaldamento errata
    Delusione del governo
    Primer di pittura scadente che può essere specifico
    Concentrazione di primer per pittura insufficiente
    Componente verbale mancante
    Condizioni di reazione non ottimali
    Modello di design di bassa qualità
    Presenza dell’inibitore durante tutta la tua reazione attuale
    Cicli non adeguati
    Programmazione del termociclatore errata
    Temperatura di inibizione variabile
    Contaminazione dei vasi impulsivi
    o soluzioni
    Modello complesso